說起腫瘤、癌癥,已經不再像多年前一樣讓談癌色變,但仍舊為人們所恐懼。成功治療腫瘤還是以早發現早治療為主。那么盡早檢測和發現腫瘤便是*的核心。液體活檢(Liquid biopsy)的檢測方法,可以捕獲到進入血液的其它細胞或DNA,從而替代了疾病的診斷,例如腫瘤。近比較火熱的液體活檢有:cfDNA(Circulating cell-free DNA)、CTC和外泌體的檢測。
對于CTC和外泌體的信息,我們已發表過2篇文章描述,欲知詳情,請瀏覽:
游離循環DNA(cfDNA)存在于血液,包含雙鏈DN**段,絕大多數是短鏈,而且通常濃度很低。在健康人體中,血漿cfDNA被認為來自于正常的造血細胞。cfDNA的循環半衰期很短,這提示它需要在細胞凋亡時被持續的釋放。在特定的生理條件或疾病過程中,有相當一部分cfDNA會與在健康的時候不同,基于這一結果,近年來cfDNA已被用于無創性診斷。在孕婦中,約有10%-15%的cfDNA來自于胎盤滋養層,現在cfDNA多用于在高危孕婦中篩查胎兒的遺傳缺陷,這就是是當前火熱的無創唐氏篩查的基礎!在腫瘤病人中,通過cfDNA的量化突變來檢測腫瘤已被越來越多的人認可。而在移植方面,移植排斥反應也與供體移植器官中的cfDNA水平相關。
Figure.2 血液中的復雜組分
而循環腫瘤DNA(ctDNA)是來源于腫瘤細胞的cfDNA,屬于cfDNA的一種類型。兩者為包含關系,ctDNA僅為cfDNA很小的一部分。ctDNA來自腫瘤細胞的體細胞突變,不同于遺傳突變的是其存在于體內每個細胞。往往在提到循環腫瘤DNA的時候,大家往往簡單的將它認為是腫瘤患者外周血中游離的DNA。其實不然,雖然ctDNA所占cfDNA的比例波動范圍非常大,約0.01%~90%,但實際上,大多數ctDNA在cfDNA中的占比約為0.2%。
如何有效分離提取cfDNA(ctDNA)用于檢測,已成為科研工作者必須突破的問題!
Nanopsy™是由先進的分子工程納米粒子Magvigen™和Myquvigen™實現的,能夠有效地從蛋白質、細胞和核酸中捕獲和識別分子信息。我們正在將nanopsy™開發成可在成百上千家醫院部署的、自動化和FDA批準的臨床儀器和試劑盒,將致命的癌癥轉變為可控制的疾病。
用鏈霉親和素珠和生物素探針捕獲DNA
Magvigen™、Myquvigen™和Maxvigen™納米顆粒是多功能和可生物降解的磁性和/或熒光磁性納米顆粒,在加利福尼亞大學、伯克利大學、斯坦福大學和NVIGEN經過18年的嚴格研究和開發后達到。
產品名稱 | 應用 | 目錄號 | 規格/價格(1ml, USD) |
MagVigen™ – Plasma DNA Capture Kit | 對血漿中的 cfDNA 的捕獲 | K61003 | Sizes (Plasma) 1,000 ml $3,999.00 |
產品介紹: MagVigen™ Plasma DNA Capture 磁性納米顆粒專為捕獲血液中的cfDNA而設計,為科研, 分子檢測工作者提供了一種簡單、快速、的血液cfDNA提取方法。整個實驗過程中無需離心或者過柱。DNA提取可以線性比例擴大,輸入血漿范圍為100 uL至10mL 。分離出的cfDNA 可以用Agilent Bioanalyzer 直接定量分析。
下游應用: PCR, DNA測序,二代測序技術(NGS), 以及測序文庫構建。
產品特點:
實驗例子:
Figure 1. cfDNA extraction yield and size from 1.5 ml plasma samples with (blue) and without (red) spiking in DNA. Calculated yield of spiking in DNA by subtraction of endogenous cfDNA from total DNA were 80% using picogreen assay and 91% with bioanalyzer quantification.
Figure 2. cfDNA extracted from 100 µl to 5 ml of plasma was quantified by pico-green analysis.
Figure 3. cfDNA extraction yield was quantified by pico-green analysis following DNA isolation with the MagVigen™ Plasma DNA Capture Kit and kit C.
Figure 4. Beta-globin level and GAPDH levels were estimated by PCR analysis.
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