arcticzymes Cod UNG說明書
來自大西洋鱈魚的鱈魚尿嘧啶-DNA糖基化酶(Cod UNG)是通過中度熱處理*不可逆地滅活的UNG酶。該酶在含有修飾的Cod UNG基因的重組大腸桿菌(ung-)菌株中產生。
高魯棒性
不耐熱,在55°C時*不可逆轉地失活
污染控制
RT-PCR,RT-qPCR,qPCR和kPCR中污染控制的理想選擇
PCR后分析
啟用PCR后分析
當今市場上有幾種可商購的尿嘧啶-DNA糖基化酶。如果您不打算在PCR后進一步分析PCR產物,則其中大多數是細菌來源的,效果很好。但是,如果要存儲PCR產物用于下游分析(例如克隆和測序),則UNG的重新激活和隨后PCR產物的降解是大多數商用UNG的問題。來自ArcticZymes的Cod UNG是當今一種可*加熱且不可逆地失活的UNG。
圖1.*,不可逆地熱滅活的UNG是Cod UNG。
如圖1所示,其中測試了各種UNG在熱滅活后的殘留活性。用dUTP和1個單位的5種不同的市售UNGs進行PCR。PCR后,將PCR產物在室溫下孵育各種時間間隔,然后加熱并隨后冷卻。PCR產物的凝膠電泳顯示UNG重新活化,因此,除了Cod UNG外,所有測試的所有UNG的PCR產物都嚴重降解。
圖2.用1 U Cod UNG(A)或1 U E.coli UNG(B)預處理并在室溫下孵育3小時的測序PCR產物的色譜圖。只有Cod UNG保留序列質量不變。
通過對PCR產物進行測序,進一步評估了PCR后序列的質量和完整性。用添加到預混物中的四種不同的市售UNG之一進行PCR。PCR后,將PCR產物在室溫或4°C下以不同的時間間隔孵育。隨后將樣品純化并測序。*分析了序列數據,重點是由于UNG重新激活而降低了序列質量。如圖2和圖3所示,用UNG處理的樣品,除用Cod UNG處理的樣品外,由于UNG的再活化而顯示出嚴重的PCR產物降解。
0h6h24hControlCod UNGSupplier ASupplier BSupplier C0100200300400500600700800900Amplicon length (bp)
0小時 | 6小時 | 24小時 | |
---|---|---|---|
控制 | 789 | 779 | 774 |
鱈魚 | 781 | 785 | 785 |
供應商A | 784 | 786 | 66 |
供應商B | 792 | 48 | |
供應商C | 801 | 221 |
圖3. UNG重新激活導致序列降解。經各種UNG預處理并在室溫下孵育的PCR產物的序列數據。除與Cod UNG一起溫育的樣品外,所有樣品均顯示UNG的重新活化和PCR產物的嚴重降解。
聚合酶鏈反應
Cod UNG適用于所有市售的預混料。確保在先前的PCR實驗中使用了包含dNTP混合物的dUTP。
在分析之前,將PCR產物在-20°C或4°C的溫度下保存盡可能長的時間。
一站式RT-PCR
Cod UNG適用于所有市售的預混料。確保在先前的PCR實驗中使用了包含dNTP混合物的dUTP。
在分析之前,將PCR產物在-20°C或4°C的溫度下保存盡可能長的時間。
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